L’emergenza di uno o più cicli auto-catalitici all’interno di una rete di molecole interagenti è una proprietà fondamentale sia nello sviluppo di possibili scenari legati all’origine della vita, sia nell’indirizzare la ricerca di laboratorio verso lo sviluppo di nuove molecole capaci di evolversi interagendo con i propri bersagli.Alcuni modelli teorici di reti catalitiche hanno dimostrato una certapredisposizione alla comparsa di cicli, fenomeno che al contrario difficilmente si riesce ad ottenere nei laboratori. UIl nostro studio prende spunto dai lavori di Stuart Kauffman eFarmer, nei quali è stato sviluppato un modello contenentedue tipi di reazioni (condensazione e cleavage) ed in cui tali reazioni vengono catalizzate dalle altre molecole presenti nel sistema.L’obiettivo del nostro lavoro è di migliorare il modello originale introducendo una dinamica stocastica delle molecole, basata sul noto algoritmo di Gillespie, in modo da poter trattare adeguatamente i problemi connessi alla numerosità degli esemplari delle varie specie molecolari, che in alcuni casi può essere anche molto bassa, e alla cinetica delle reazioni. Discutiamo il tipo di analisi di rete necessario per interpretare gli schemi di reazione stocastici

Quando un insieme di reazioni è autocatalitico / Filisetti, A.; Serra, Roberto; Villani, Marco; Carletti, T.; Füchslin, R. M.; Poli, I.. - STAMPA. - (2009), pp. 83-89. (Intervento presentato al convegno VI Workshop Italiano di Vita Artificiale e Computazione Evolutiva tenutosi a Napoli nel 23-25 Novembre 2009).

Quando un insieme di reazioni è autocatalitico

SERRA, Roberto;VILLANI, Marco;
2009

Abstract

L’emergenza di uno o più cicli auto-catalitici all’interno di una rete di molecole interagenti è una proprietà fondamentale sia nello sviluppo di possibili scenari legati all’origine della vita, sia nell’indirizzare la ricerca di laboratorio verso lo sviluppo di nuove molecole capaci di evolversi interagendo con i propri bersagli.Alcuni modelli teorici di reti catalitiche hanno dimostrato una certapredisposizione alla comparsa di cicli, fenomeno che al contrario difficilmente si riesce ad ottenere nei laboratori. UIl nostro studio prende spunto dai lavori di Stuart Kauffman eFarmer, nei quali è stato sviluppato un modello contenentedue tipi di reazioni (condensazione e cleavage) ed in cui tali reazioni vengono catalizzate dalle altre molecole presenti nel sistema.L’obiettivo del nostro lavoro è di migliorare il modello originale introducendo una dinamica stocastica delle molecole, basata sul noto algoritmo di Gillespie, in modo da poter trattare adeguatamente i problemi connessi alla numerosità degli esemplari delle varie specie molecolari, che in alcuni casi può essere anche molto bassa, e alla cinetica delle reazioni. Discutiamo il tipo di analisi di rete necessario per interpretare gli schemi di reazione stocastici
2009
VI Workshop Italiano di Vita Artificiale e Computazione Evolutiva
Napoli
23-25 Novembre 2009
83
89
Filisetti, A.; Serra, Roberto; Villani, Marco; Carletti, T.; Füchslin, R. M.; Poli, I.
Quando un insieme di reazioni è autocatalitico / Filisetti, A.; Serra, Roberto; Villani, Marco; Carletti, T.; Füchslin, R. M.; Poli, I.. - STAMPA. - (2009), pp. 83-89. (Intervento presentato al convegno VI Workshop Italiano di Vita Artificiale e Computazione Evolutiva tenutosi a Napoli nel 23-25 Novembre 2009).
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