Evaluation of HIV transmission clusters among natives and foreigners living in Italy

Fabeni, L.; Santoro, M. M.; Lorenzini, P.; Rusconi, S.; Gianotti, N.; Costantini, A.; Sarmati, L.; Antinori, A.; Ceccherini-Silberstein, F.; d'Arminio Monforte, A.; Saracino, A.; Girardi, E.; Castagna, A.; Castelli, F.; Cauda, R.; Di Perri, G.; Galli, M.; Iardino, R.; Ippolito, G.; Lazzarin, A.; Marchetti, G. C.; Rezza, G.; von Schloesser, F.; Viale, P.; Cozzi-Lepri, A.; Gori, A.; Lo Caputo, S.; Maggiolo, F.; Mussini, C.; Puoti, M.; Perno, C. F.; Bai, F.; Bandera, A.; Bonora, S.; Borderi, M.; Calcagno, A.; Capobianchi, M. R.; Cicalini, S.; Cingolani, A.; Cinque, P.; Di Biagio, A.; Gagliardini, R.; Guaraldi, G.; Lapadula, G.; Lichtner, M.; Lai, A.; Madeddu, G.; Merlini, E.; Nozza, S.; Piconi, S.; Pinnetti, C.; Quiros Roldan, E.; Rossotti, R.; Spagnuolo, V.; Svicher, V.; Taramasso, L.; Fanti, I.; Galli, L.; Rodano, A.; Macchia, M.; Tavelli, A.; Bove, A.; Camposeragna, A.; Errico, M.; Manfredini, M.; Perziano, A.; Calvino, V.; Carrara, S.; Di Caro, A.; Graziano, S.; Petroni, F.; Prota, G.; Truffa, S.; Giacometti, A.; Barocci, V.; Angarano, G.; Monno, L.; Milano, E.; Suardi, C.; Donati, V.; Verucchi, G.; Castelnuovo, F.; Minardi, C.; Menzaghi, B.; Abeli, C.; Chessa, L.; Pes, F.; Cacopardo, B.; Celesia, B.; Vecchiet, J.; Falasca, K.; Pan, A.; Lorenzotti, S.; Sighinolfi, L.; Segala, D.; Blanc, P.; Vichi, F.; Cassola, G.; Bassetti, M.; Alessandrini, A.; Bobbio, N.; Mazzarello, G.; Fondaco, L.; Bonfanti, P.; Molteni, C.; Chiodera, A.; Milini, P.; Nunnari, G.; Pellicano, G.; Rizzardini, G.; Cannizzo, E. S.; Moioli, M. C.; Piolini, R.; Bernacchia, D.; Poli, A.; Tincati, C.; Puzzolante, C.; Migliorino, C.; Sangiovanni, V.; Borgia, G.; Esposito, V.; Di Flumeri, G.; Gentile, I.; Rizzo, V.; Cattelan, A. M.; Marinello, S.; Cascio, A.; Trizzino, M.; Francisci, D.; Schiaroli, E.; Parruti, G.; Sozio, F.; Lazzaretti, C.; Corsini, R.; Cristaudo, A.; Vullo, V.; Acinapura, R.; Lamonica, S.; Capozzi, M.; Mondi, A.; Rivano Capparuccia, M.; Iaiani, G.; Latini, A.; Onnelli, G.; Plazzi, M. M.; de Girolamo, G.; Vergori, A.; Cecchetto, M.; Viviani, F.; de Vito, A.; Rossetti, B.; Montagnani, F.; Franco, A.; Fontana Del Vecchio, R.; Di Giuli, C.; Caramello, P.; Orofino, G. C.; Sciandra, M.; Londero, A.; Manfrin, V.; Battagin, G.; Starnini, G.; Ialungo, A.

doi:10.3390/v12080791

We aimed at evaluating the characteristics of HIV-1 molecular transmission clusters (MTCs) among natives and migrants living in Italy, diagnosed between 1998 and 2018. Phylogenetic analyses were performed on HIV-1 polymerase (pol) sequences to characterise subtypes and identify MTCs, divided into small (SMTCs, 2-3 sequences), medium (MMTCs, 4-9 sequences) and large (LMTCs, ≥10 sequences). Among 3499 drug-naïve individuals enrolled in the Italian Cohort Naive Antiretroviral (ICONA) cohort (2804 natives; 695 migrants), 726 (20.8%; 644 natives, 82 migrants) were involved in 228 MTCs (6 LMTCs, 36 MMTCs, 186 SMTCs). Migrants contributed 14.4% to SMTCs, 7.6% to MMTCs and 7.1% to LMTCs, respectively. HIV-1 non-B subtypes were found in 51 MTCs; noteworthy was that non-B infections involved in MTCs were more commonly found in natives (n = 47) than in migrants (n = 4). Factors such as Italian origin, being men who have sex with men (MSM), younger age, more recent diagnosis and a higher CD4 count were significantly associated with MTCs. Our findings show that HIV-1 clustering transmission among newly diagnosed individuals living in Italy is prevalently driven by natives, mainly MSM, with a more recent diagnosis and frequently infected with HIV-1 non-B subtypes. These results can contribute to monitoring of the HIV epidemic and guiding the public health response to prevent new HIV infections.

Evaluation of HIV transmission clusters among natives and foreigners living in Italy / Fabeni, L.; Santoro, M. M.; Lorenzini, P.; Rusconi, S.; Gianotti, N.; Costantini, A.; Sarmati, L.; Antinori, A.; Ceccherini-Silberstein, F.; d'Arminio Monforte, A.; Saracino, A.; Girardi, E.; Castagna, A.; Castelli, F.; Cauda, R.; Di Perri, G.; Galli, M.; Iardino, R.; Ippolito, G.; Lazzarin, A.; Marchetti, G. C.; Rezza, G.; von Schloesser, F.; Viale, P.; Cozzi-Lepri, A.; Gori, A.; Lo Caputo, S.; Maggiolo, F.; Mussini, C.; Puoti, M.; Perno, C. F.; Bai, F.; Bandera, A.; Bonora, S.; Borderi, M.; Calcagno, A.; Capobianchi, M. R.; Cicalini, S.; Cingolani, A.; Cinque, P.; Di Biagio, A.; Gagliardini, R.; Guaraldi, G.; Lapadula, G.; Lichtner, M.; Lai, A.; Madeddu, G.; Merlini, E.; Nozza, S.; Piconi, S.; Pinnetti, C.; Quiros Roldan, E.; Rossotti, R.; Spagnuolo, V.; Svicher, V.; Taramasso, L.; Fanti, I.; Galli, L.; Rodano, A.; Macchia, M.; Tavelli, A.; Bove, A.; Camposeragna, A.; Errico, M.; Manfredini, M.; Perziano, A.; Calvino, V.; Carrara, S.; Di Caro, A.; Graziano, S.; Petroni, F.; Prota, G.; Truffa, S.; Giacometti, A.; Barocci, V.; Angarano, G.; Monno, L.; Milano, E.; Suardi, C.; Donati, V.; Verucchi, G.; Castelnuovo, F.; Minardi, C.; Menzaghi, B.; Abeli, C.; Chessa, L.; Pes, F.; Cacopardo, B.; Celesia, B.; Vecchiet, J.; Falasca, K.; Pan, A.; Lorenzotti, S.; Sighinolfi, L.; Segala, D.; Blanc, P.; Vichi, F.; Cassola, G.; Bassetti, M.; Alessandrini, A.; Bobbio, N.; Mazzarello, G.; Fondaco, L.; Bonfanti, P.; Molteni, C.; Chiodera, A.; Milini, P.; Nunnari, G.; Pellicano, G.; Rizzardini, G.; Cannizzo, E. S.; Moioli, M. C.; Piolini, R.; Bernacchia, D.; Poli, A.; Tincati, C.; Puzzolante, C.; Migliorino, C.; Sangiovanni, V.; Borgia, G.; Esposito, V.; Di Flumeri, G.; Gentile, I.; Rizzo, V.; Cattelan, A. M.; Marinello, S.; Cascio, A.; Trizzino, M.; Francisci, D.; Schiaroli, E.; Parruti, G.; Sozio, F.; Lazzaretti, C.; Corsini, R.; Cristaudo, A.; Vullo, V.; Acinapura, R.; Lamonica, S.; Capozzi, M.; Mondi, A.; Rivano Capparuccia, M.; Iaiani, G.; Latini, A.; Onnelli, G.; Plazzi, M. M.; de Girolamo, G.; Vergori, A.; Cecchetto, M.; Viviani, F.; de Vito, A.; Rossetti, B.; Montagnani, F.; Franco, A.; Fontana Del Vecchio, R.; Di Giuli, C.; Caramello, P.; Orofino, G. C.; Sciandra, M.; Londero, A.; Manfrin, V.; Battagin, G.; Starnini, G.; Ialungo, A.. - In: VIRUSES. - ISSN 1999-4915. - 12:8(2020), pp. N/A-N/A. [10.3390/v12080791]

Evaluation of HIV transmission clusters among natives and foreigners living in Italy

Fabeni L.;Santoro M. M.;Lorenzini P.;Rusconi S.;Gianotti N.;Costantini A.;Sarmati L.;Antinori A.;Ceccherini-Silberstein F.;d'Arminio Monforte A.;Saracino A.;Girardi E.;Castagna A.;Castelli F.;Cauda R.;Di Perri G.;Galli M.;Iardino R.;Ippolito G.;Lazzarin A.;Marchetti G. C.;Rezza G.;von Schloesser F.;Viale P.;Cozzi-Lepri A.;Gori A.;Lo Caputo S.;Maggiolo F.;Mussini C.;Puoti M.;Perno C. F.;Bai F.;Bandera A.;Bonora S.;Borderi M.;Calcagno A.;Capobianchi M. R.;Cicalini S.;Cingolani A.;Cinque P.;Di Biagio A.;Gagliardini R.;Guaraldi G.;Lapadula G.;Lichtner M.;Lai A.;Madeddu G.;Merlini E.;Nozza S.;Piconi S.;Pinnetti C.;Quiros Roldan E.;Rossotti R.;Spagnuolo V.;Svicher V.;Taramasso L.;Fanti I.;Galli L.;Rodano A.;Macchia M.;Tavelli A.;Bove A.;Camposeragna A.;Errico M.;Manfredini M.;Perziano A.;Calvino V.;Carrara S.;Di Caro A.;Graziano S.;Petroni F.;Prota G.;Truffa S.;Giacometti A.;Barocci V.;Angarano G.;Monno L.;Milano E.;Suardi C.;Donati V.;Verucchi G.;Castelnuovo F.;Minardi C.;Menzaghi B.;Abeli C.;Chessa L.;Pes F.;Cacopardo B.;Celesia B.;Vecchiet J.;Falasca K.;Pan A.;Lorenzotti S.;Sighinolfi L.;Segala D.;Blanc P.;Vichi F.;Cassola G.;Bassetti M.;Alessandrini A.;Bobbio N.;Mazzarello G.;Fondaco L.;Bonfanti P.;Molteni C.;Chiodera A.;Milini P.;Nunnari G.;Pellicano G.;Rizzardini G.;Cannizzo E. S.;Moioli M. C.;Piolini R.;Bernacchia D.;Poli A.;Tincati C.;Puzzolante C.;Migliorino C.;Sangiovanni V.;Borgia G.;Esposito V.;Di Flumeri G.;Gentile I.;Rizzo V.;Cattelan A. M.;Marinello S.;Cascio A.;Trizzino M.;Francisci D.;Schiaroli E.;Parruti G.;Sozio F.;Lazzaretti C.;Corsini R.;Cristaudo A.;Vullo V.;Acinapura R.;Lamonica S.;Capozzi M.;Mondi A.;Rivano Capparuccia M.;Iaiani G.;Latini A.;Onnelli G.;Plazzi M. M.;de Girolamo G.;Vergori A.;Cecchetto M.;Viviani F.;de Vito A.;Rossetti B.;Montagnani F.;Franco A.;Fontana Del Vecchio R.;Di Giuli C.;Caramello P.;Orofino G. C.;Sciandra M.;Londero A.;Manfrin V.;Battagin G.;Starnini G.;Ialungo A.

2020

Abstract

We aimed at evaluating the characteristics of HIV-1 molecular transmission clusters (MTCs) among natives and migrants living in Italy, diagnosed between 1998 and 2018. Phylogenetic analyses were performed on HIV-1 polymerase (pol) sequences to characterise subtypes and identify MTCs, divided into small (SMTCs, 2-3 sequences), medium (MMTCs, 4-9 sequences) and large (LMTCs, ≥10 sequences). Among 3499 drug-naïve individuals enrolled in the Italian Cohort Naive Antiretroviral (ICONA) cohort (2804 natives; 695 migrants), 726 (20.8%; 644 natives, 82 migrants) were involved in 228 MTCs (6 LMTCs, 36 MMTCs, 186 SMTCs). Migrants contributed 14.4% to SMTCs, 7.6% to MMTCs and 7.1% to LMTCs, respectively. HIV-1 non-B subtypes were found in 51 MTCs; noteworthy was that non-B infections involved in MTCs were more commonly found in natives (n = 47) than in migrants (n = 4). Factors such as Italian origin, being men who have sex with men (MSM), younger age, more recent diagnosis and a higher CD4 count were significantly associated with MTCs. Our findings show that HIV-1 clustering transmission among newly diagnosed individuals living in Italy is prevalently driven by natives, mainly MSM, with a more recent diagnosis and frequently infected with HIV-1 non-B subtypes. These results can contribute to monitoring of the HIV epidemic and guiding the public health response to prevent new HIV infections.

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	Anno di pubblicazione
	
			2020
		
	Rivista
	
			VIRUSES
		
	N° del Volume
	
			12
		
	Fascicolo
	
			8
		
	Pagina iniziale
	
			N/A
		
	Pagina finale
	
			N/A
		
	Codice DOI
	
			https://dx.doi.org/10.3390/v12080791
		
	Codice WoS
	
			WOS:000579573600001
		
	Codice Scopus
	
			2-s2.0-85088812438
		
	Codice PubMed
	
			32718024
		
	Citazione
	
			Evaluation of HIV transmission clusters among natives and foreigners living in Italy / Fabeni, L.; Santoro, M. M.; Lorenzini, P.; Rusconi, S.; Gianotti, N.; Costantini, A.; Sarmati, L.; Antinori, A.; Ceccherini-Silberstein, F.; d'Arminio Monforte, A.; Saracino, A.; Girardi, E.; Castagna, A.; Castelli, F.; Cauda, R.; Di Perri, G.; Galli, M.; Iardino, R.; Ippolito, G.; Lazzarin, A.; Marchetti, G. C.; Rezza, G.; von Schloesser, F.; Viale, P.; Cozzi-Lepri, A.; Gori, A.; Lo Caputo, S.; Maggiolo, F.; Mussini, C.; Puoti, M.; Perno, C. F.; Bai, F.; Bandera, A.; Bonora, S.; Borderi, M.; Calcagno, A.; Capobianchi, M. R.; Cicalini, S.; Cingolani, A.; Cinque, P.; Di Biagio, A.; Gagliardini, R.; Guaraldi, G.; Lapadula, G.; Lichtner, M.; Lai, A.; Madeddu, G.; Merlini, E.; Nozza, S.; Piconi, S.; Pinnetti, C.; Quiros Roldan, E.; Rossotti, R.; Spagnuolo, V.; Svicher, V.; Taramasso, L.; Fanti, I.; Galli, L.; Rodano, A.; Macchia, M.; Tavelli, A.; Bove, A.; Camposeragna, A.; Errico, M.; Manfredini, M.; Perziano, A.; Calvino, V.; Carrara, S.; Di Caro, A.; Graziano, S.; Petroni, F.; Prota, G.; Truffa, S.; Giacometti, A.; Barocci, V.; Angarano, G.; Monno, L.; Milano, E.; Suardi, C.; Donati, V.; Verucchi, G.; Castelnuovo, F.; Minardi, C.; Menzaghi, B.; Abeli, C.; Chessa, L.; Pes, F.; Cacopardo, B.; Celesia, B.; Vecchiet, J.; Falasca, K.; Pan, A.; Lorenzotti, S.; Sighinolfi, L.; Segala, D.; Blanc, P.; Vichi, F.; Cassola, G.; Bassetti, M.; Alessandrini, A.; Bobbio, N.; Mazzarello, G.; Fondaco, L.; Bonfanti, P.; Molteni, C.; Chiodera, A.; Milini, P.; Nunnari, G.; Pellicano, G.; Rizzardini, G.; Cannizzo, E. S.; Moioli, M. C.; Piolini, R.; Bernacchia, D.; Poli, A.; Tincati, C.; Puzzolante, C.; Migliorino, C.; Sangiovanni, V.; Borgia, G.; Esposito, V.; Di Flumeri, G.; Gentile, I.; Rizzo, V.; Cattelan, A. M.; Marinello, S.; Cascio, A.; Trizzino, M.; Francisci, D.; Schiaroli, E.; Parruti, G.; Sozio, F.; Lazzaretti, C.; Corsini, R.; Cristaudo, A.; Vullo, V.; Acinapura, R.; Lamonica, S.; Capozzi, M.; Mondi, A.; Rivano Capparuccia, M.; Iaiani, G.; Latini, A.; Onnelli, G.; Plazzi, M. M.; de Girolamo, G.; Vergori, A.; Cecchetto, M.; Viviani, F.; de Vito, A.; Rossetti, B.; Montagnani, F.; Franco, A.; Fontana Del Vecchio, R.; Di Giuli, C.; Caramello, P.; Orofino, G. C.; Sciandra, M.; Londero, A.; Manfrin, V.; Battagin, G.; Starnini, G.; Ialungo, A.. - In: VIRUSES. - ISSN 1999-4915. - 12:8(2020), pp. N/A-N/A. [10.3390/v12080791]
		
	Tutti gli autori
	
			Fabeni, L.; Santoro, M. M.; Lorenzini, P.; Rusconi, S.; Gianotti, N.; Costantini, A.; Sarmati, L.; Antinori, A.; Ceccherini-Silberstein, F.; d'Arminio Monforte, A.; Saracino, A.; Girardi, E.; Castagna, A.; Castelli, F.; Cauda, R.; Di Perri, G.; Galli, M.; Iardino, R.; Ippolito, G.; Lazzarin, A.; Marchetti, G. C.; Rezza, G.; von Schloesser, F.; Viale, P.; Cozzi-Lepri, A.; Gori, A.; Lo Caputo, S.; Maggiolo, F.; Mussini, C.; Puoti, M.; Perno, C. F.; Bai, F.; Bandera, A.; Bonora, S.; Borderi, M.; Calcagno, A.; Capobianchi, M. R.; Cicalini, S.; Cingolani, A.; Cinque, P.; Di Biagio, A.; Gagliardini, R.; Guaraldi, G.; Lapadula, G.; Lichtner, M.; Lai, A.; Madeddu, G.; Merlini, E.; Nozza, S.; Piconi, S.; Pinnetti, C.; Quiros Roldan, E.; Rossotti, R.; Spagnuolo, V.; Svicher, V.; Taramasso, L.; Fanti, I.; Galli, L.; Rodano, A.; Macchia, M.; Tavelli, A.; Bove, A.; Camposeragna, A.; Errico, M.; Manfredini, M.; Perziano, A.; Calvino, V.; Carrara, S.; Di Caro, A.; Graziano, S.; Petroni, F.; Prota, G.; Truffa, S.; Giacometti, A.; Barocci, V.; Angarano, G.; Monno, L.; Milano, E.; Suardi, C.; Donati, V.; Verucchi, G.; Castelnuovo, F.; Minardi, C.; Menzaghi, B.; Abeli, C.; Chessa, L.; Pes, F.; Cacopardo, B.; Celesia, B.; Vecchiet, J.; Falasca, K.; Pan, A.; Lorenzotti, S.; Sighinolfi, L.; Segala, D.; Blanc, P.; Vichi, F.; Cassola, G.; Bassetti, M.; Alessandrini, A.; Bobbio, N.; Mazzarello, G.; Fondaco, L.; Bonfanti, P.; Molteni, C.; Chiodera, A.; Milini, P.; Nunnari, G.; Pellicano, G.; Rizzardini, G.; Cannizzo, E. S.; Moioli, M. C.; Piolini, R.; Bernacchia, D.; Poli, A.; Tincati, C.; Puzzolante, C.; Migliorino, C.; Sangiovanni, V.; Borgia, G.; Esposito, V.; Di Flumeri, G.; Gentile, I.; Rizzo, V.; Cattelan, A. M.; Marinello, S.; Cascio, A.; Trizzino, M.; Francisci, D.; Schiaroli, E.; Parruti, G.; Sozio, F.; Lazzaretti, C.; Corsini, R.; Cristaudo, A.; Vullo, V.; Acinapura, R.; Lamonica, S.; Capozzi, M.; Mondi, A.; Rivano Capparuccia, M.; Iaiani, G.; Latini, A.; Onnelli, G.; Plazzi, M. M.; de Girolamo, G.; Vergori, A.; Cecchetto, M.; Viviani, F.; de Vito, A.; Rossetti, B.; Montagnani, F.; Franco, A.; Fontana Del Vecchio, R.; Di Giuli, C.; Caramello, P.; Orofino, G. C.; Sciandra, M.; Londero, A.; Manfrin, V.; Battagin, G.; Starnini, G.; Ialungo, A.
		
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